Working Packages - Walison Dev

FHU GLIMMER

Workpackages GLIMMER

Glimmer est composé de 6 Workpakages (groupes de travail) qui ont pour but de mettre en place des
actions pour favoriser l'émergence de projets et aider les partenaires de la FHU à construire leur
projet au sein de GLIMMER, notamment en identifiant les collaborateurs et les expertises
appropriées. Chaque groupe de travail (Workpakage) est coordonné par 2 membres experts.

Maladies gastro-intestinales

Le WP1 a pour objectif de développer des approches thérapeutiques personnalisées pour le traitement des MICI et de dépister et prévenir les complications de cette pathologie.

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Maladies du Foie

Le WP2 a pour objectifs d’identifier les facteurs responsables de la progression de la fibrose et d’améliorer la prise en charge de la cirrhose et de ses complications.

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Oncologie

Le WP3 a pour objectif de mettre en place des projets pour mieux comprendre les facteurs qui modulent la réponse à l’immunothérapie des cancers MSI, et à améliorer le dépistage non invasif des cancers

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Nutrition

Le WP4 a pour objectifs de mieux comprendre les liens entre la santé digestive et les troubles nutritionnels

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Education

Le WP5 est chargé des actions de communication et de formation : partager l’information entre professionnels via webinaires, newsletters et réseaux sociaux

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Valorisation

Le WP6 a pour objectif de renforcer la valorisation de la recherche en accompagnant et conseillant les équipes académiques, tout en facilitant le transfert vers l’industrie

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Les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI), telles que la maladie de Crohn et la rectocolite hémorragique, touchent près de 5 personnes sur 1 000 dans le monde, avec un risque cumulatif à vie atteignant 1 %. Ces pathologies chroniques, incurables et encore mal comprises, présentent une grande variabilité d’évolution, et il n’existe à ce jour aucune stratégie personnalisée validée pour guider les traitements.

L’objectif du WP1 est de développer une approche thérapeutique sur-mesure fondée sur le profil individuel des patients, tout en approfondissant les mécanismes physiopathologiques des MICI. Nos travaux s’appuieront sur des données de santé en vie réelle provenant de plusieurs sources :

Les cohortes dédiées telles que SUVIMIC
L’entrepôt de données de santé de l’AP-HP (EDS)
Le SNDS, base nationale de données médico-administratives

Nous ciblerons différentes étapes clés du parcours de soins : diagnostic précoce (<6 mois), première immunosuppression, changement de traitement, chirurgie, apparition d’un cancer, ou population âgée. À partir de marqueurs cliniques, biologiques et microbiotiques, nous chercherons à :

Définir des profils de maladie pertinents
Identifier des biomarqueurs prédictifs
Explorer des thérapies ciblées sur le microbiote (ex. : transplantation de microbiote fécal, probiotiques de nouvelle génération)

Ce projet de recherche translationnelle s’appuiera sur plusieurs biobanques (SUIVITHEQUE, BIOMHOST, COSMIC) et essais cliniques (MIRACLE, REBALANCE, IMPACT) afin d’alimenter des expérimentations en laboratoire (in vitro, in vivo, modèles axéniques). Résultats attendus : des outils d’aide à la décision thérapeutique, une meilleure compréhension des MICI, et le développement de traitements innovants et personnalisés.

Responsables du groupe de travail

Développer des approches thérapeutiques personnalisées pour les MICI

Maladies gastro-intestinales

Les maladies chroniques du foie, qu’elles soient liées à l’alcool, à un dysfonctionnement métabolique, à des hépatites virales chroniques ou à des affections plus rares comme la cholangite ou l’hépatite auto-immune, sont en constante augmentation et génèrent une charge importante pour les systèmes de santé. Leur progression vers la fibrose puis la cirrhose entraîne des complications sévères telles que l’hypertension portale avec ascite, l’encéphalopathie hépatique, les hémorragies digestives et le cancer primitif du foie — autant de facteurs associés à une surmortalité significative.

Le WP2 vise à améliorer le pronostic des patients atteints des pathologies hépatiques en :

Identifiant les facteurs cliniques, biologiques et radiologiques responsables de la progression de la maladie et des événements hépatiques
Optimisant la prise en charge de la cirrhose et de ses complications, du dépistage précoce aux soins de fin de vie

Pour cela, nous exploiterons les données issues de cohortes cliniques afin de caractériser les profils de risque. Une attention particulière sera portée au rôle du microbiote intestinal, étudié à la fois chez l’humain et dans des modèles animaux. Des interventions ciblées seront évaluées, notamment la transplantation de microbiote fécal (FMT), avec des études en cours telles que PHRC FMT-SCLER, afin de corriger les dysbioses et d’en mesurer l’impact sur l’évolution des maladies hépatiques. Parallèlement, le WP2 développera des stratégies intégrées de détection précoce et de prise en charge personnalisée des complications, en particulier dans les cas de cancer primitif du foie. L’objectif final est d’identifier de nouvelles approches thérapeutiques capables de réduire significativement la morbidité et la mortalité liées aux maladies chroniques du foie.

Responsables du groupe de travail

Réduire la morbidité et la mortalité dans les maladies chroniques du foie

Maladies du foie

Les cancers gastro-intestinaux (GI), en particulier ceux à début précoce, peuvent survenir dans un contexte de prédisposition génétique, comme le syndrome de Lynch (1 porteur sur 300) ou la polypose adénomateuse familiale (PAF), ou de maladies somatiques telles que les MICI. Face à une grande variabilité interindividuelle du risque, l’identification des facteurs modificateurs est essentielle pour adapter les stratégies de prévention et de traitement. Le groupe a pour ambition de développer une plateforme de phénotypage approfondi afin de :

Identifier les paramètres influençant le risque de cancer digestif chez les individus à haut risque, notamment le microbiote intestinal
Prédire l’efficacité des thérapies anticancéreuses dans ce contexte de prédisposition héréditaire ou acquis

Ce projet s’appuiera sur le programme hospitalo-universitaire AI-TRIOMPH RHU, ainsi que sur plusieurs cohortes prospectives existantes, telles que PREDIF (prédisposition génétique aux cancers digestifs) et immunoMSI (patients traités par immunothérapie pour des cancers à instabilité des microsatellites), en lien avec les données de vie réelle issues de réseaux cliniques spécialisés (PREDIF-SU, GERCOR). En réalisant un phénotypage approfondi (intégrant les caractéristiques du patient, du microbiote, de la maladie prédisposante et du cancer), le WP3 vise à poser les bases d’une oncologie de précision pour la prévention et la prise en charge des cancers digestifs.

Responsables du groupe de travail

Prédisposition aux cancers digestifs : vers une approche personnalisée

Oncologie Digestive

Les troubles liés à la nutrition, tels que l’obésité et le diabète, représentent un défi majeur pour la santé digestive. Ils entraînent des déséquilibres du microbiote intestinal, de l’inflammation chronique et des altérations de l’absorption des nutriments. Ces pathologies sont aussi liées à des modifications des hormones incrétines, notamment le GLP-1, dont les analogues thérapeutiques, bien que bénéfiques, peuvent provoquer des effets secondaires digestifs. Malgré le lien reconnu entre alimentation et maladies digestives (MICI, MAFLD, cancer colorectal), ce champ reste encore peu exploré.

Le WP4 vise à mieux comprendre la santé digestive dans le contexte des troubles métaboliques et à concevoir des stratégies nutritionnelles personnalisées, en particulier pour les patients traités par analogues du GLP-1. Le projet s’appuiera sur plusieurs cohortes existantes et à venir (Pineapple, NutriMcheck, études GLP-1) pour analyser l’interaction entre alimentation, microbiote, profils métaboliques et inflammation. Des modèles avancés, tels que les organoïdes humains et les systèmes organ-on-chip, seront utilisés pour étudier les mécanismes de régulation des hormones incrétines. Les outils nutritionnels développés dans le cadre du WP4 contribueront également à enrichir les autres work packages via une caractérisation globale des patients.

Responsables du groupe de travail

Amélioration de la santé digestive lors des troubles liés à la nutrition

Nutrition

Le Work package Education, a pour objectif de renforcer la formation et la diffusion des connaissances dans les domaines des maladies digestives et du microbiote intestinal. GLIMMER s’engage à former les futurs professionnels de santé, les chercheurs et les personnels paramédicaux — acteurs clés dans l’éducation des patients. Deux Diplômes Universitaires, « Prise en charge multidisciplinaire des pathologies digestives sévères » et « Microbiote intestinal et santé », coordonnés par des membres de GLIMMER et impliquant de nombreux partenaires, seront actualisés et enrichis.

Par ailleurs, des séminaires scientifiques seront organisés tous les deux mois, réunissant les membres de GLIMMER, des intervenants extérieurs et des partenaires industriels afin de favoriser les échanges et les synergies au sein du réseau.

Responsables du groupe de travail

Éducation et diffusion des connaissances

Education

Le Work Package Valorisation vise à transformer l’excellence scientifique de GLIMMER en retombées concrètes, en renforçant la dimension translationnelle et la valorisation industrielle des travaux menés. Les maladies digestives constituent un champ de recherche académique et appliquée particulièrement dynamique. L’approche interdisciplinaire de GLIMMER; alliant sciences fondamentales, expertise clinique, intelligence artificielle et technologies innovantes; représente un atout majeur pour établir des collaborations solides avec des partenaires industriels.

Cette synergie permettra d’agir à la fois en amont, pour stimuler la découverte, et en aval, pour accélérer la mise en œuvre clinique des innovations. GLIMMER s’appuiera également sur les réseaux existants de ses membres pour développer des partenariats public/privé à fort potentiel de transfert.

Workpackages GLIMMER

Maladies gastro-intestinales

Maladies du Foie

Oncologie

Nutrition

Education

Valorisation

Pr. Philippe SEKSIK

Pr. Jérémie LEFEVRE

Responsables du groupe de travail

Développer des approches thérapeutiques personnalisées pour les MICI

Maladies gastro-intestinales

Pr Sara LEMOINNE

Pr Dominique THABUT

Responsables du groupe de travail

Réduire la morbidité et la mortalité dans les maladies chroniques du foie

Maladies du foie

Pr Jean B. BACHET

Pr Romain COHEN

Responsables du groupe de travail

Prédisposition aux cancers digestifs : vers une approche personnalisée

Oncologie Digestive

Pr Karine CLÉMENT

Dr Pierre Bel LASSEN

Responsables du groupe de travail

Amélioration de la santé digestive lors des troubles liés à la nutrition

Nutrition

Pr Franck VERDONK

Pr Patrick BENUSIGLIO

Responsables du groupe de travail

Éducation et diffusion des connaissances

Education

Pr Xavier DRAY

Pr Philippe LANGELLA

Responsables du groupe de travail

Valorisation et partenariats stratégiques

Valorisation

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